Οι πολυκυστικές ωοθήκες είναι ίσως η πιο συχνή αιτία υπογονιμότητας στις νεαρές γυναίκες.
Το κύριο πρόβλημα στις γυναίκες με πολυκυστικές ωοθήκες είναι ότι δεν κάνουν ωορρηξία. Ο γυναικολόγος αναπαραγωγής έχει ως στόχο να επιτύχει ωορρηξία με τη βοήθεια της κατάλληλης φαρμακευτικής αγωγής, ανάλογα με τις ιδιαίτερες ανάγκες κάθε γυναίκας, είτε με χάπια (κλομιφαίνη) είτε με ενέσεις (γοναδοτροφίνες)
Αν αυτό επιτευχθεί, η γονιμοποίηση μπορεί να γίνει με εξωσωματική γονιμοποίηση, φυσιολογικά (με επαφή στο σπίτι) ή με σπερματέγχυση. Αυτό θα εξαρτηθεί από διάφορους παράγοντες.